MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 7715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015564	CAGC	2	8	2880133	2880140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_015564	CCT	2	6	2880184	2880189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_015564	CCGG	2	8	2880378	2880385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_015564	CGC	2	6	2880414	2880419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_015564	AAG	2	6	2880456	2880461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_015564	CG	3	6	2880487	2880492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_015564	CGC	2	6	2880500	2880505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_015564	CTG	2	6	2880545	2880550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_015564	AGC	2	6	2880572	2880577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_015564	GCTG	2	8	2880590	2880597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_015564	CTG	2	6	2880659	2880664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_015564	GCATC	2	10	2884382	2884391	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4513	NC_015564	GAC	2	6	2894043	2894048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_015564	CCG	2	6	2894049	2894054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_015564	GAC	2	6	2894101	2894106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_015564	CACC	2	8	2896437	2896444	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4517	NC_015564	TGTC	2	8	2896448	2896455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_015564	CCCT	2	8	2896499	2896506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4519	NC_015564	CTG	2	6	2896689	2896694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_015564	CCG	2	6	2896731	2896736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4521	NC_015564	CAC	2	6	2896797	2896802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_015564	GC	3	6	2896811	2896816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_015564	CAGG	2	8	2896834	2896841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_015564	ACCT	2	8	2896870	2896877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_015564	GTC	2	6	2896949	2896954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_015564	CCG	2	6	2897004	2897009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_015564	CCG	2	6	2897119	2897124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_015564	CCG	2	6	2897182	2897187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_015564	CGGG	2	8	2897193	2897200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4530	NC_015564	GCC	2	6	2897281	2897286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_015564	CGA	2	6	2897336	2897341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_015564	GTG	2	6	2899731	2899736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_015564	GGC	2	6	2899780	2899785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_015564	GCT	2	6	2899796	2899801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_015564	CG	4	8	2899852	2899859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_015564	TAC	2	6	2899867	2899872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_015564	ACC	2	6	2899911	2899916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_015564	ACG	2	6	2899946	2899951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_015564	CTGT	2	8	2900097	2900104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4540	NC_015564	TTC	2	6	2900162	2900167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_015564	GTA	2	6	2900185	2900190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_015564	GCA	2	6	2900207	2900212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_015564	CGA	2	6	2900270	2900275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_015564	CGC	2	6	2900336	2900341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_015564	CTA	2	6	2900357	2900362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_015564	TTG	2	6	2900475	2900480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_015564	CAC	2	6	2900669	2900674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_015564	CCG	2	6	2900715	2900720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_015564	ATC	2	6	2900787	2900792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_015564	AGAA	2	8	2900841	2900848	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_015564	CCGA	2	8	2900852	2900859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_015564	GTC	2	6	2901687	2901692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_015564	GCAC	2	8	2901715	2901722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_015564	GACC	2	8	2901760	2901767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_015564	AGGA	2	8	2901772	2901779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_015564	TGG	2	6	2903517	2903522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_015564	GCT	2	6	2903530	2903535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_015564	CTG	2	6	2904958	2904963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_015564	CAT	2	6	2904992	2904997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_015564	CGA	2	6	2905060	2905065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_015564	GGGT	2	8	2905107	2905114	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_015564	TCC	2	6	2905952	2905957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_015564	CCG	2	6	2906583	2906588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_015564	GCC	2	6	2906607	2906612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_015564	TGG	2	6	2906644	2906649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_015564	AAT	2	6	2906657	2906662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_015564	GAT	2	6	2906675	2906680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_015564	GCC	2	6	2906731	2906736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4569	NC_015564	GGT	2	6	2906811	2906816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015564	TGG	2	6	2906849	2906854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015564	CAGC	2	8	2906897	2906904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_015564	CTA	2	6	2906911	2906916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_015564	CCG	2	6	2906933	2906938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_015564	CAA	2	6	2906947	2906952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_015564	TCG	2	6	2907091	2907096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_015564	AGGG	2	8	2907099	2907106	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_015564	TCG	2	6	2908272	2908277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_015564	TGA	2	6	2908323	2908328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_015564	GCG	2	6	2908345	2908350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_015564	AGC	2	6	2908377	2908382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_015564	GCA	2	6	2908387	2908392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_015564	GAA	2	6	2908526	2908531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_015564	ACG	2	6	2908541	2908546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_015564	CCG	2	6	2908644	2908649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_015564	TTCA	2	8	2910006	2910013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_015564	AAGG	2	8	2910093	2910100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_015564	CAAT	2	8	2910134	2910141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4588	NC_015564	CTCAC	2	10	2910181	2910190	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4589	NC_015564	CGG	2	6	2911079	2911084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_015564	AGA	2	6	2911868	2911873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_015564	CCA	2	6	2911937	2911942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_015564	AGCG	2	8	2911995	2912002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4593	NC_015564	CTA	2	6	2912048	2912053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_015564	CG	3	6	2914060	2914065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_015564	ACG	2	6	2914113	2914118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_015564	ACC	2	6	2914173	2914178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_015564	GGTG	2	8	2918820	2918827	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_015564	GAT	2	6	2918858	2918863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_015564	TC	3	6	2918943	2918948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_015564	CG	3	6	2919112	2919117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_015564	CTT	2	6	2919133	2919138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_015564	CGA	2	6	2922391	2922396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_015564	TCA	2	6	2927320	2927325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_015564	GTT	2	6	2927335	2927340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_015564	TCA	2	6	2927369	2927374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_015564	GGAA	2	8	2927382	2927389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_015564	CG	3	6	2936383	2936388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_015564	CTC	2	6	2936408	2936413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_015564	ATT	2	6	2937309	2937314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015564	GA	3	6	2937346	2937351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_015564	CGC	3	9	2937427	2937435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_015564	GCG	2	6	2937475	2937480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_015564	CGCT	2	8	2937979	2937986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_015564	ACT	2	6	2938027	2938032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_015564	T	6	6	2938062	2938067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_015564	CCG	2	6	2938822	2938827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_015564	TGA	2	6	2938832	2938837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_015564	AAT	2	6	2941456	2941461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_015564	AC	3	6	2941467	2941472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4620	NC_015564	CGT	2	6	2941541	2941546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_015564	CGG	2	6	2944904	2944909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_015564	GAG	2	6	2944932	2944937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_015564	CAG	2	6	2946761	2946766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_015564	CCT	2	6	2946768	2946773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_015564	TGC	2	6	2946820	2946825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_015564	CCG	2	6	2947383	2947388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_015564	CCTCTC	2	12	2948119	2948130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_015564	GCG	2	6	2948170	2948175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_015564	CGA	2	6	2949621	2949626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_015564	AACG	2	8	2949680	2949687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4747	NC_015564	GCG	2	6	3024998	3025003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4757	NC_015564	ACC	2	6	3036666	3036671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4758	NC_015564	TCA	2	6	3042240	3042245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4760	NC_015564	GCGA	2	8	3043167	3043174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4761	NC_015564	CGA	2	6	3043223	3043228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4765	NC_015564	TG	3	6	3045346	3045351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4892	NC_015564	CGA	2	6	3129173	3129178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4894	NC_015564	TGCG	2	8	3129236	3129243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4895	NC_015564	G	6	6	3129266	3129271	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5000	NC_015564	CGA	2	6	3167325	3167330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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